hhnaotoさん、こんにちは
普通はないことですよねぇ。なんでしょうか。
いろいろ試されたと存じますので恐縮ですが僕が考えたのは。
・デフォルトのフォントが特殊とか…
例えば漢字は書けないカタカナだけの日本語フォントなどがあります。
それが文字パネルでのフォントに選ばれていると漢字部分が空白で表示されます。
こんな簡単な原因しか思いつけませんでした。さすがに違いますよね。
・メモ帳などに打った字をコピーして貼り付けてみた場合は？
・日本語ではなく半角のアルファベットや数字だけなら見れますか？
・新規プロジェクト/新規コンポ/新規テキストレイヤーだけでも同じ症状でしょうか？
とりあえず今文字パネルのフォントは何になっていて、
どんな文章を打ったのかが分かれば有効な回答があると思います。
症状が起こる時の文字パネルやコンポジションパネルの
スクリーンショット画像を提供いただければ幸いです！
After Effectsのバージョンや使用OSの情報もぜひお願いします